Počkejte prosím...
Data pro 2018/2019

Laboratorní projekt I

Kredity 2
Rozsah 0 / 3 / 0
Examinace KZ
Jazyk výuky čeština
Úroveň magisterský předmět
Garant Ing. Jiří Znamenáček

Anotace

Předmět slouží k praktickému procvičení základních bioinformatických algoritmů. Používaným programovacím jazykem je Python.

Sylabus

Rekurze, memoizace, dynamické programování.
Hledání vzorů.
Zarovnávání sekvencí.
Klastrování.
Fylogenetické stromy.

Literatura

Z: Libeskind-Hadas, Ran; Bush, Eliot: "Computing for Biologists: Python Programming and Principles"
Z: Jones, Neil C.; Pevzner, Pavel A.: "An Introduction to Bioinformatics Algorithms"
D: Stevens, Tim J.; Boucher, Wayne: "Python Programming for Biology: Bioinformatics and Beyond"
D: Haddock, Steven H.D.; Dunn, Casey W.: "Practical Computing for Biologists"
D: Bassi, Sebastian: "Python for Bioinformatics"

VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČO: 60461373
DIČ: CZ60461373

Datová schránka: sp4j9ch

Copyright VŠCHT Praha 2014
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum
zobrazit plnou verzi