Data pro 2018/2019
Molekulární modelování
Kredity | 4 |
Rozsah | 1 / 2 / 0 |
Examinace | Zk |
Jazyk výuky | čeština |
Úroveň | magisterský předmět |
Garant |
doc. Ing. Stanislav Böhm, CSc. prof. RNDr. Petr Bouř, CSc. |
Elektronické materiály | dostupné v e-learningu VŠCHT |
Anotace
Student se seznámí se základy kvantové mechaniky, molekulové mechaniky, a výpočetních postupů v chemii. Důraz je kladen na spektroskopické metody, jako vibrační a NMR spektroskopie. Přednáška je doplněná cvičením na počítačích.
Sylabus
1. Koncepce molekulárního modelování
2. Numerické řešení Schroedingerovy rovnice
3. Základní pojmy kvantového popisu
4. Predikce vlastností molekul
5. Úvod do výpočetní kvantové mechaniky
6. Pokročilé ab initio metody
7. Empirické modely silového pole
8. Minimalizace energie a příbuzné metody
9. Konformační analýza
10. Simulace spektrálních vlastností
11. Predikce struktury proteinů, sekvenční analýza a skládání proteinů
12. Modelování monomolekulárních vrstev
13. Volná energie, solvatace, reakce a defekty pevného stavu v molekulárních modelech
14. Užití molekulárního modelování a chemické informace při navrhování nových struktur
2. Numerické řešení Schroedingerovy rovnice
3. Základní pojmy kvantového popisu
4. Predikce vlastností molekul
5. Úvod do výpočetní kvantové mechaniky
6. Pokročilé ab initio metody
7. Empirické modely silového pole
8. Minimalizace energie a příbuzné metody
9. Konformační analýza
10. Simulace spektrálních vlastností
11. Predikce struktury proteinů, sekvenční analýza a skládání proteinů
12. Modelování monomolekulárních vrstev
13. Volná energie, solvatace, reakce a defekty pevného stavu v molekulárních modelech
14. Užití molekulárního modelování a chemické informace při navrhování nových struktur
Literatura
Z: P. Bouř, Základy kvantových výpočtů molekul http://hanicka.uochb.cas.cz/~bour/prednaska/skripta.pdf
Z: manual www.gaussian.com
D: A. Szabo, N. S. Ostlund: Modern Quantum Chemistry: Introduction to Advanced Electronic Structure Theory
D: P. W. Atkins, R. S. Friedman, Molecular Quantum Mechanics
Z: manual www.gaussian.com
D: A. Szabo, N. S. Ostlund: Modern Quantum Chemistry: Introduction to Advanced Electronic Structure Theory
D: P. W. Atkins, R. S. Friedman, Molecular Quantum Mechanics