Celoškolská pracoviště (studium mimo fakulty)
Velkou část své profesní dráhy zasvětil Jan Vlachý oblasti financí, která pro něj vždy představovala především tvůrčí řešení širokého spektra interdisciplinárních problémů, ať už se jí věnoval v řídících pozicích, v projektech nebo na akademické půdě. Tento svůj přístup a bohaté zkušenosti se snaží zprostředkovat i studentům. Jeho vědeckou a publikační činnost také často charakterizují mezioborové přesahy, od analýz nákladů životního cyklu produktů, přes finanční modelování a oceňování v podmínkách nejistoty, až po vybrané otázky historie financí a mezinárodního obchodu. Dalším jeho zájmem je internacionalizace, kterou považuje za nedílnou součást tvůrčí činnosti i vysokoškolského vzdělávání. Podílí se na mezinárodních projektech, vyučuje na zahraničních univerzitách a v ekonomických programech VŠCHT se stará o rozšiřování příležitostí pro studium v cizím jazyce, včetně společných studijních programů.