Lenka Mynaříková přednáší předměty z oblasti sociální a manažerské psychologie. Ve své výzkumné činnosti se věnuje především forenzní psychologii (problematika detekce lži s využitím verbálních a neverbálních signálů a technologií, odhalování a prevence finančních podvodů, korporátní psychopatie), pedagogické a školní psychologii (rozvoj digitálních kompetencí učitelů, prevence kyberšikany) a možnostem využití neurotechnologií ke zvýšení kvality života. Je řešitelkou a spoluřešitelkou projektů TAČR a GAČR.